Mit Drupal 6 fliegt hook_regions raus aus der template.php. Dort verankerte Blöcke müssen nun dort raus und in das entsprechende .info File des Templates:
regions[left] = Left sidebar
regions[right] = Right sidebar
regions[content] = Content
regions[header] = Header
regions[footer] = Footer
Weiterführendes unter http://drupal.org/node/132442 .